Da, este o mare deosebire între ele. Căci botezul lui Ioan Botezătorul nu era taină, ci numai simbol. El nu curăţa păcatele, fiindcă nu era cu Duh, ci numai cu apă. Prin scufundarea în apă el nu mai simboliza curăţirea internă. Deosebirea între cele două botezuri au făcut-o:
Însuşi Ioan Botezătorul când a zis: „Eu vă botez cu apă spre pocăinţă, dar Cel Ce vine după mine (...) vă va boteza cu Duhul Sfânt şi cu foc” (Mt 3, 11);
Mântuitorul, când a spus ucenicilor Săi după Înviere: „Ioan a botezat cu apă, dar voi veţi fi botezaţi întru Duhul Sfânt, nu mult după aceste zile” (FA 1, 5);
Apostolii înşişi, cu deosebire Sfântul Apostol Pavel, care i-a botezat cu Botezul creştin pe nişte foşti ucenici de-ai lui Ioan în Efes, deşi aceştia primiseră mai înainte botezul lui Ioan (FA 19, 1-6).
Deosebirea trebuie s-o facem şi noi, deoarece astăzi există, chiar şi printre noi, multe comunităţi religioase neoprotestante, care nu fac această deosebire şi care practică un botez asemănător celui al lui Ioan, ca simbol, şi nu ca Taină, dându-i forma creştină doar prin rostirea formulei: „În numele Tatălui şi al Fiului şi al Sfântului Duh”.